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傳染病預防控制國家重點實驗室(State Key Laboratory of Infectious Disease Prevention and Control, SKLID)于2005年3月22 日經科技部批準正式成立、進入建設時期。2011年1月7日通過評估。SKLID 的依托單位為中國疾病預防控制中心,學術委員會主任為中國疾病預防控制中心主任王宇教授,實驗室主任為徐建國研究員。

霍亂組在Journal of Microbiological Methods上發表論文

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霍亂組在Journal of Microbiological Methods上發表論文

2007年10月,重點實驗室霍亂組在Journal of microbiological Methods上發表題為“Comparison of different electrophoretic parameters of Pulse-Field Gel Electrophoresis for Vibrio cholerae subtyping”的論文。該研究中,對霍亂弧菌利用不同電泳條件進行脈沖場凝膠電泳(PFGE)分析,用統計學方法比較了不同條件下產生的分子分型指紋圖譜之間的相似系數,從中確定了具有最大區分能力的電泳條件。這種分析方法能為其他細菌分子分型標準化方案的確定提供參考。


在傳染病監測中,為反映病原菌的變異、暴發流行中的菌株差別以及進行分子進化分析,需要對病原體進行分子分型。另外作為傳染病監測網絡,需要這個網絡中的不同實驗室采用一致的方法進行病原菌的確認和分子分型,使不同實驗室的分型結果具有可比性,便于信息交流,為此需要建立標準化的分子分型方案。PFGE是其中一種高效的分子分型技術,重復性好,區分能力強,結果的解釋更直接,被推薦作為多種致病菌分子分型的參考方法,在疾病暴發調查中發揮了重要作用,已成為病原菌分子分型監測的國際化網絡PulseNet的基本技術。PFGE用于細菌分型時,電泳條件的選擇是影響分型結果的重要因素。如何確定一個電泳參數為最佳條件是需要首先明確的問題。但是以往PFGE電泳條件的確定主要依靠肉眼觀察條帶的分布情況,沒有一種客觀評價其優劣的方法。該研究就是試圖尋找一種客觀、可靠的確定最優電泳條件的方法。研究中選擇了不同年代不同地區的O1群El Tor型和O139群霍亂弧菌為測試株,以NotⅠ內切酶對霍亂弧菌染色體酶切,分別以對酶切后的DNA大小片段具有不同區分能力的4種電泳條件做PFGE分析。對給定菌株的分型圖譜的聚類,以具備最小的相似系數、這些菌株間圖譜差別就最大、則該電泳參數對這些菌株的區分能力最強作為原則,利用相似系數的秩和的群組比較和兩組比較檢驗,比較了每種電泳參數所得圖譜的相似系數,選出最小的一組相似系數對應的條件,確定了此條件對測試株有最大區分能力。


該研究建立了一種在霍亂弧菌進行PFGE分析中篩選優化電泳條件的分析過程,這一分析方法和過程也同樣能應用于其它細菌確定分子分型的最佳電泳參數的選擇以及最佳內切酶的選擇,從而建立網絡中標準化的方案。


該文第一作者是重點實驗室的張京云,其他作者包括重點實驗室的刁保衛、崔志剛、章麗娟、徐建國研究員和闞飆研究員,以及山東大學公共衛生學院的張娜。重點實驗室闞飆研究員為責任作者。該研究受國家十五科技攻關計劃課題(2003BA712A05-04)資助。


檢索信息為:


Journal of Microbiological Methods. 71 (2007) 15-22.


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